Marcusaurelius no se trata de código javascript al que se le pasa una variable php. Sino que se trata código php, en el que va incluido código javascript a través de la instrucción echo.
Dentro de ese código javascript, necesitamos utilizar una variable php de nuevo.
Código:
<?php $ident= 11; $resultado = mysql_query( "SELECT `COURSE_NAME`,`IDLINK`,`CURSO` FROM `cursos_training` WHERE `FLOWROLE`=" .$ident);
if ($fila = mysql_fetch_array($resultado)){ $numCurso = $fila['CURSO']; $nombre = $fila['COURSE_NAME']; $course = $fila['IDLINK']; $course = "\"" .$course ."\"";
echo '<a href=\"javascript:\$(\'#contentFlow\').load(\'curso1_info.php?id=11001\');\" class=\"course11\" id=\"course11\" style=\"color:#FFF; font-size:25px; text-decoration:none; margin-bottom:40px;\">' .nl2br($numCurso)." - " .$nombre."<br>" ."<br>" ."</a>";
?>";
Pero muchas gracias!!!