solo me tira la primera búsqueda y el resto no

[pateketrueke]

No se cual de ambas funciones estés probando, pero al menos con preg_match_all() no resulta porque la expresión es demasiado ambiciosa.

Voy a omitir ereg() porque sencillamente está obsoleta.

Código PHP:

<?php
 
function cortar2($fuente,$izq,$der){
    $izq = preg_quote($izq,'/');
    $der = preg_quote($der,'/');
    preg_match_all("/".$izq."(.+)".$der."/", $fuente, $salida);
    return $salida;
}
 
$cadena= '<etiqueta>uno</etiqueta> contenido <etiqueta>dos</etiqueta> sigue el contenido <etiqueta>uno</etiqueta>';
$cadena = cortar2($cadena, '<etiqueta>','</etiqueta>');
 
var_dump($cadena);
 
/*
array(2) {
  [0] =>
  array(1) {
    [0] =>
    string(103) "<etiqueta>uno</etiqueta> contenido <etiqueta>dos</etiqueta> sigue el contenido <etiqueta>uno</etiqueta>"
  }
  [1] =>
  array(1) {
    [0] =>
    string(82) "uno</etiqueta> contenido <etiqueta>dos</etiqueta> sigue el contenido <etiqueta>uno"
  }
}
*/
 

Y desde luego el resultado es muy lejos de lo que dices "anda perfecto", así que al menos con preg_match_all() no sirve lo que mencionas.

Ahora, si cambio la captura de (.+) a (.+?) ya funciona perfecto, pues la expresión es menos ambiciosa y analiza todos los pares de etiquetas, etc.