Cita: el caso es que usa phpmyadmin 5.1 y no encuentro el boton para relacionar las tablas como en el 5.6.
¿No estarás refiriendote a
MySQL 5.1 y 5.6?
La última versión estable de phpMyadmin es la 4.2.9.1, no existe una 5.x estable...
no te olvides que phpMyadmin
no es MySQL, sino una interfaz de acceso a MySQL.
En todo caso, peudes usar em MySQL Workbench para crear las relaciones en tu propia PC, y luego subir el sript compelto a donde quieras. No entiendo por qué estás subiendo uno que no contiene las FK...