Pues tienes dos opciones a mi parecer, o creas una sola consulta y vas creando las tablas comparando o simplemente creas dos consultas por aparte lo cual a mi parecer es mas facil.
Porque no puedes crear las dos consultas? (una del 2013 y otra del 2014?)
Yo sugiero que crearas una función en la cual tu le indicas que año deseas de la consulta y que cree las tablas, algo asi como:
Código PHP:
function_creatabla($anio){
$query="select * from tabla where año=".$anio;
////aqui iria el resto del codigo
}
De esa forma seria reutilizable el codigo, no se si esto solucione el problema