Problema con XmlReader

[el junco]

Hola,

Me encuentro con un problema a la hora de utilizar XmlReader en Java.
El xml que tengo que parsear contiene querys de sql en tags <sql>, es un xml largo y me lo parsea bien cuando lo ahago en mi local con JBoss y en Windows. Una de esas querys es bastante larga, unos 3000 caracteres.

Pues cuando se realiza el mismo parseo en otro servidor Jboss desplegado en Linux esa query larga no la parsea bien, me la voge a partir de cierta palabra y hasta el final, si sacas algún trozo de la query sigue cogiendo la desde el mismo punto.

Teniendo en cuenta que los Jboss tiene los dos como encoding UTF-8, la version de Java de windows es la 1.6.0_45 y en linux tengo la 1.6.0_32, y el xml tiene como cabecera

Muchas gracias,