Buenas,
Realmente es extraño tu caso... No parece que hagas nada mal sino que se trata de algún bug extraño.
Que versión 4.1 de Glassfish te has bajado, la final? o una beta?.
La has bajado de aquí?
https://glassfish.java.net/download.html#gfoseTab
Si es así parece que has encontrado un bug crítico, sería muy útil si lo reportas al equipo indicando toda tu infomación (equipo, versión de java, etc) para ver si consiguen reproducirlo y corregirlo cuanto antes:
https://java.net/jira/browse/GLASSFI...n-issues-panel
Un saludo