UPDATE consumidor de memoria

[David_Carrera_G]

Estimados, la creación de esta pregunta es por un problema de optimización en el cual estoy trabajando, resulta que estamos realizando llenado a una base de datos a través de archivos planos, las tablas a las que llegan estos datos no poseen ningún tipo de indice ni constraint respectivamente, pero una vez cuando realizamos la normalizacion de la data y la introducimos en el modelo relacional que tenemos, esta se demora alrededor de 4 horas en actualizar algunos campos, cabe mencionar que estamos trabajando con app 3 a 4 millones de datos, es por esta razón que pregunto:

¿Existe alguna manera de abordar los UPDATE a una tabla como más de 3 millones de datos?