Cita:
Iniciado por ponyboy 
son dos dominios y hosting distintos.
tenía duda sobre si al hacer esto podía penalizar en el SEO.
Hola
ponyboy
Tal práctica no va a penalizar de modo alguno tu estrategia SEO; pero puedo garantizarte que va a ensuciar mucho tus métricas. Si pensamos que estos números te ayudarán a tomar una buena decisión en algún momento, no veo que esta modalidad sea la mejor.
Mi recomendación: distintos sitios Web → independientes códigos de Analytics
Saludos