Los Physical Volumes (PV) de LVM en general NO se redimensionan (se puede hacer, pero no es la idea). LVM es un gestor de "volúmenes", donde un "volumen" es un disco o una partición. En LVM la gracia es que agregas particiones o discos a un Volume Group para gestionar tu espacio.
De todas maneras el problema raíz es el uso de una herramienta de imagen de particiones (CloneZilla) para migrar datos. Al hacer una copia bloque a bloque, copia también los datos de la partición, incluídos su tipo y tamaño. Para estos casos se utiliza una herramienta de backup, no de imagen.
La solución sencilla es volver a conectar el disco de 300GB, y copiar con rsync (o tar) los datos al disco de 1TB, luego de formatearlo, para asegurarte de que los permisos quedan como están.
La solución "correcta" aprovechando las capacidades de LVM, es agregar el disco de 1TB a tu Volume Group (el que contiene al disco de 300GB), luego quitar el de 300GB. Esto es, por supuesto, usando los programas adecuados en la línea de comandos para eliminar el disco, no simplemente desconectándolo.
Te recomiendo buscar documentación detallada, pero por acá hay un ejemplo en RedHat usando pmove / vgreduce
https://access.redhat.com/documentat...remove_ex.html