Comparar datos antes de insertar

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Segun entiendo estas haciendo un presupuesto de una posible venta, la forma correcta sería al agregar cada item de tu presupuesto corroborar primero con el stock y luego aceptar el producto, claro que esto no te garantiza que el producto al momento de convertir el presupuesto a factura exista o cuente con existencia en el stock, para eso debes utilizar TRANSACCIONES.
Explicando un poco al intentar convertir tu presupuesto a factura debes asegurarte de que cada item de tu presupuesto no supere a la existencia en el stock,
1 Inicias transaccion START TRANSACTION
2 Traes el primer item de tu presupuesto y descuentas del stock, registras en la ficha de E/S producto y detalles de factura.
Si falla o no cubre el stock simplemente envias un ROLLBACK y finaliza todo el proceso.
Si fue exitoso sigue con el siguiente item de tu presupuesto haciendo lo del paso 2.
3 Si no hubo fallos en tu presupuesto confirmas lso cambios con COMMIT.

OBS: al hacer ROLLBACK toda la base de datos te queda intacta por mas de que hayas hecho insert update y delete, y con COMMIT confirmas todos estos cambios.