Muy fácil, sólo debes colocar en el action la URL completa del dominio alternativo:
Código PHP:
Ver original<form action="http://sub2.principal.com/upload.php">
Es decir, el script que recibe el formulario no debe estár siempre en el mismo subdominio, es completamente normal apuntarlo a otro distinto.
Consulta el manual:
http://php.net/manual/es/features.file-upload.php