Lo veo complicado, Bootstrap es una librería/framework de CSS avanzado que sólo soportan los navegadores más modernos.
¿De verdad crees que se puede utilizar una tecnología tan avanzada en un PDF?
No lo creo, existen implementaciones como DOMPDF y así, pero ninguna tiene un soporte completo, y menos aún soporte para CSS 3.
Creo que no es posible lo que buscas, así que te sugiero mejor expliques la razón de hacer esto: que no sea sólo porque sí.