Input text php javascript

[dcuartas]

Buenos Dias Espero me puedan ayudar y hacerme entender
tengo una tabla en la cual hago una consulta de unas dependencias y subdependencias tengo 2 columnas una de nombre y otra de telefono las cuales son input text, las lleno trayendo la informacion de una ventana emergente o esa es la idea como en algunas consultas hay mas de una fila entonces el input text se llama igual y no se como hacer para que co un contador no lo haga pero tambien lo pueda llamar en la funcion javascript que estoy haciendo esa es mi pregunta como llamar el input en php y javascript anexo los 2 pedazos de codigo espero me ayuden gracias

Código HTML:

<td> <input type="text" name="nombre1"  size="35" onClick="ventana_habilitar()" readonly value="<?php echo $lis['0'];  ?>"></td>
                              <td> <input type="text" name="telefono" size="35" readonly value="<?php echo $lis['1']; ?>"> </td>
                              <?php } ?>
                              <td> <input type="date" name="fecha_inicio" ></td>
                              <td> <input type="date" name="fecha_fin" id="fecha_fin"></td>
                              <td> <input  type="hidden" name="consecutivo"></td> 
                              <td> <input  type="hidden" name="consecutivo2" value="<?php echo $usu; ?>"></td>
                              <td> <input type="hidden" name="cons_disp" value="<?php echo $dis; ?>"> </td>
 

Código Javascript:

<script>
var parametro;
var cont=<?php echo $cont; ?>;
    function ventana_habilitar()
    {
        parametro=window.open("tabla.php", "habilita","width=530,height=600,top=25,left=500 ");
        parametro.document.getElementById('0').value="nombre1=[cont]";
        parametro.document.getElementById('1').value="telefono=[cont]";
        parametro.document.getElementById('2').value="consecutivo";
        parametro.document.getElementById('3').value="cons_subdependencia";
        
    }
    
    function lis_habilitar(nombre, telefono, consecutivo)
    {
        opener.document.habilita.nombre1=[cont].value=nombre;
        opener.document.habilita.telefono=[cont].value=telefono;
        opener.document.habilita.consecutivo.value=consecutivo;
        close();
 
    }
    
    }
    
 
</script>