buenas...
te respondo según mi experimento. EPS es como una versión "reducida" de PostScript (PS). PS viene en tres niveles, Level 3 siendo el más reciente con mayores features. según entiendo,
PS Level 3 tiene soporte para gradiantes. lo que puedes hacer es salvar el gráfico en EPS con PostScript Level 3, siempre y cuando las condiciones en Shutter te lo permita. sin embargo, el problema lo podría tener los usuarios si el programa donde utilicen el archivo EPS no tenga soporte para PostScript Level 3. también podrias usar PostScript Level 2 pero, a mi mejor entender, automaticamente el editor rasteriza el gradiante. lo cual trae el problema de que luego pierde calidad al redimensionarse.