Cita: Cuando utilizo esta misma aplicación como librería de una Web Aplicattion (WAR), llamo al mismo método y no funciona. Ya agregué el certificado que utiliza el web service a cacerts
La sensacion que da es que lo has aniadido al JDK del que tira Netbeans pero no del que tira el servidor de aplicaciones que ejecuta el .war.
Esto es lo que te esta diciendo Xerelo ya desde su primer mensaje y por algun extranio motivo no le contestas.
Un saludo