[consulta] actualzación de CMS customizado

[pamda]

buenas a tod@s...

tengo una consulta con respecto a mantener actualizado los CMS que usamos en nuestros desarrollos web, los mismos han sido customizado hasta más no poder.

En otras palabras, se han sacado cosas que solo ocupaban espacio en disco.

Por mencionar a uno de los CMS, Joomla!
Entonces, ¿como podemos llevar nuestro proyecto a la par de las actualizaciones que se efectuan en Joomla! u otro CMS?, ya que en función de que pasa el tiempo se van detectando los bugs..
y tener que actualizar tu proyecto con la nueva actualizacion, muchas veces no es bienvenida. Ya que corremos el riesgo de tener que hacer un doble trabajo.

Aguardo sus respuesta, gracias por su tiempo!