Yo tampoco termino de entenderte demasiado, pero creo que lo que intentas es hacer una consulta a varias tablas, este seria un ejemplo que se puede acercar a lo que pides:
Código PHP:
$query = "SELECT Tema.Id as IdTema, Tema.StrTitulo as TituloTema, Tema.StrContenido as ContenidoTema,
Tema.StrTitulo as TituloTema, Unidad.StrTitulo as TituloUnidad
FROM Tema, Unidad, Curso
WHERE Tema.Id_Unidad=Unidad.Id and Unidad.Id_Curso=Curso.Id and Tema.Id = " . $_GET['IdTema']" ";
He relacionado en la misma select las tres tablas y cogido los campos que me interesan de cada una.
Solo a modo de consejo para la próxima, el nombre de las tablas siempre en plural: Temas, Unidades, Cursos...