Cita:
Iniciado por pateketrueke 
Primero aprende a separar las cosas, de otra forma nadie te va a querer ayudar.
¿La consulta de SQL ya la solucionaste?
Si no los hecho aún no esperes a que "una sentencia de PHP" solucione el problema.
Cuando tengas la consulta de SQL resuelta verás que ejecutar código PHP para la misma es pan comido.
PDTA: por eso existen sub-foros especializados, si no aprendes a preguntar donde corresponde no esperes "ayuda" donde no la hay.
Nuevamente gracias pude conseguir mi consulta mysql que me muestra lo que quiero
SELECT a.barra,b.cantidad FROM control_stock_fisico AS a
LEFT JOIN stock AS b
ON a.barra = b.barra
WHERE a.barra = b.barra AND a.cantidad < b.cantidad OR b.cantidad = '0'
ahora quisiera trasladarlo a una sentencia php para poder imprimir la consulta
muchas gracias.-