Puedes usar una variable para ir sumando los valores en el bucle, algo así (no sé si me habré dejado alguna comilla o algo por ahí):
Código PHP:
Ver original{assign var="total" value=0}
{section name=i loop=$lista}
{$lista[i]->codigoVO}
{$lista[i]->cargoVO}
{$lista[i]->abonoVO}
{assign var="total" value=$total+$lista[i]->cargoVO+$lista[i]->abonoVO}
{/section}
total: {$total}