Las placas no se desconfiguran por que pruebes otro hdd, la verdad no se donde has podido leer esa tontería. 
   Cita:  Ahora estoy viendo de cargar los controladores desde un pendrive para que levante el hdd
    Aparte de innecesario es inútil, no hace falta para nada.  
 Cita:  El problema es q si pongo el disco no arranca ni bios ni nada
    Ese hdd parece estar estropeado. Conectalo en otro pc como secundario a ver si arranca o intenta pasarle alguna herramienta como hdd regenerator, pero tiene mala pinta. 
PD: Jamas, jamas conectes o desconectes un sata en caliente, esa operación solo se puede realizar con los discos scsi.