El primer comentario en isemail.info dice:
Cita:
For the benefit of people who think this service can test whether an email address actually exists: it doesn't.
This service tests whether an email address has a valid format. I've tried to make this clearer on the Help page and in the diagnostic text.
En resumen: El servicio (y también filter_var) verifica que la dirección de correo tenga un formato válido, no es para saber si existe o no.
Tal vez quieras crear una función o expresión regular donde verifiques todas las extensiones de dominio, cosa que será muy difícil de lograr, aunque no imposible.