¿Has ejecutado los ejemplos de los tutoriales y te pasa lo mismo?
http://www.fpdf.org/es/tutorial/index.php
Lo de visualizarlo en otra ventana,
aquí dice que "You should create the new tab before running the FPDF code"
En este
otro sitio pone "You can either use the target="_blank" attribute with the <a> or <form> tags or use JavaScript to open a new window."