Buenos días a todos. Estoy atascado y no doy con la solución a este problema. 
 
Tengo un documento donde al realizar una búsqueda mediante PHP me muestra los datos y me los muestra con un checkbox en el lado izquierdo.
Cuando encuentra solamente uno y lo seleccionas y pulsas crear escrito te crea perfectamente el escrito correspondiente. 
Si realizas la búsqueda y salen más de 1 el javaScript falla.
No sé de qué manera se pueden almacenar los datos y pueda ir enviando uno a uno... 
OS dejo el código a ver podéis echarme un cable. 
¡ GRACIAS!   
/*Código JavaScript*/ 
 Código PHP:
    <script type="text/javascript">
function crearEscritosMasivos(){
 
     var referencia = $("#referenciaID").val(); 
     var escrito = $("#escritoExpediente").val(); 
     var checkboxValues = new Array();
//recorremos todos los checkbox seleccionados con .each
     if (escrito != -1){
         $('#referenciaID :checked').each(function() {
    //$(this).val() es el valor del checkbox correspondiente
    checkboxValues.push($(this).val());
    
});
         /*Abre en una pestaña*/
    window.open("../models/Escritos.php?referencia="+referencia+"&escrito="+escrito, '_blank');
                
            }
        }
</script> 
   
  
/*Código PHP*/ 
 Código PHP:
    if($fecha=""){
$busqueda = "SELECT * FROM usuarios WHERE fecha like '$fecha'";
                }
            $result = mysqli_query($conexion, $busqueda);
                    while ($f= mysqli_fetch_array($result)){     
                   $dni = $f['dni'];        
 
                  echo '<form name="formExpedientesEncontrados">';
                  echo '<tr><th>'.'<input type="checkbox" id = "dniID" name="dniID" value='.$f['dni'].'>'.'</th>';
                           echo "<th>".$f['dni']."</th>";
                           echo "<th>".$f['nombre']."</th>";                               
                           echo "</tr>";
                           echo '</form>';
 
 
                       }
 
$countRegistros = count($result);
    if ($countRegistros != 0){
        echo '<label>Escrito</label>
             <select class="form-control" id="escritoExpediente">
              <option value="-1">Selecciona Escrito</option>
                <option value="escrito1">AUTORIZACION PADRES</option>
                <option value="escrito2">SEGURO ACTIVIDAD</option>
                <option value="escrito3">RESEÑA EXCELENCIA</option>
                       
</select>';
 
 
    echo '<div class="text-left">';
        
        echo '<button type="button" class="btn btn-primary btn-sm" onclick="crearEscritosMasivos(this)">CREAR ESCRITOS</button>';
        echo '<br>';