Me autorespondo.
La solución es subir un .htaccess
en mi caso me ha funcionado con este código:
Código:
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ index.php?/$1 [L]
RewriteEngine on
RewriteCond $1 !^(index\.php|images|assets|robots\.txt)
RewriteRule ^(.*)$ /index.php/$1 [L]