Me parece perfecto.
La personalización de un esquema es una alternativa. Es decir, puedes basarte en un estándar, pero que luego se adapta a las necesidades de cada empresa; en esos casos una base por empresa es una buena idea.
Lo que si te recomiendo es el uso de un gestor de proyectos como GIT para mantener documentados los cambios en cada caso. Es fácil perderse en la maraña de cosas cuando vas avanzando con cada uno.
Otra fuente que puedes explorar es esta, donde encontrarás estructuras conceptuales para casi cada rubro:
http://www.databaseanswers.org/data_...all_models.htm