Cita: Y el problema que veo es que al ejecutar el script no me indica nada asta pulsar f5. ya que entonces estoy viendo que no me lo genera en la primera ejecución del script.
Ese es el comportamiento normal de las cookies, ¿no leíste el manual?
Las cookies son un mecanismo que viaja como header-http, pero depende también del navegador así que para que puedas "recibir" una cookie aunque la hayas creado ahí mismo tendrás que esperar a que lleguen al navegador y éste las envíe de vuelta.
Así que no hay forma de evitar que esto suceda.