Lo que sucede es que el formulario no te da la solución, es tu lógica la que debe resolver el problema.
Bien podrías llamar al input "imagen_nueva" y al mismo tiempo podrías actualizar cualquier dato de tu array, o en la base de datos, etc.
Da igual como recibes la información, pues sólo tu sabes "que debes actualizar la segunda imagen" y eso no te obliga a nombrar de una manera especial tus campos: es irrelevante.
Si pudieras mostrar exactamente cómo es tu rutina entenderíamos mejor lo que has intentado hasta ahora, de otra forma es seguir adivinando.
