Como insertan un campo checkbox en mi DB

[pateketrueke]

La siguiente expresión no tiene sentido:

Código PHP:

!empty(", ", $_POST['id_alimentos'])
 

¿Qué hace o cual es su propósito?

A partir de ese punto $_POST['id_alimentos'] es un array y debes tratarlo como tal, no puedes hacer lo siguiente:

Código PHP:

$sql="INSERT INTO empresas (id_alimentos) VALUES ('".$_POST[id_alimentos']."')";
 

Eso literalmente pondría "Array" y no es lo que buscas, primero debes extraer y concatenar los valores en una cadena de texto simple.