Pues al igual que lo haces en el código php que pasaste:
Código PHP:
<?php
$n=1;
while($fila=mysql_fetch_array($sql)){
?>
<td><input type="text" id="n" value="<?php echo $n; ?>"></td>
<td><?php echo '<strong>'.$fila['apellidos']. ' ' .$fila['nombres'].'</strong>'; ?></td>
<td> <input type="number" name="inas" size="1" maxlength="2" style="width:50px" value="0" step="1" max="8" min="1" ></td>
<td> <input type="number" id="A<?php echo $n; ?>" style="width:50px" value="0" max="5" min="1" autofocus></td>
<td> <input type="number" id="B<?php echo $n; ?>" style="width:50px" value="0" max="5" min="1"></td>
<td> <input type="number" id="<?php echo $n; ?>" style="width:50px" value="0" max="5" min="1" onChange="calcular(this.id);"></td>
<td> <input type="number" id="resultado<?php echo $n; ?>" style="width:50px" value="0" step="0.1" max="5" min="1"></td>
<td> </td>
<td></td>
<tr></tr>
<?php
$n++;
}
?>