Pues si dicho CLI de Ghostscript requiere una ruta ¿cual es el problema?
Si tuvieras que ingresar el contenido del PDF como un argumento más entonces sería demasiado complejo escribirlo así como asegurar que la sintaxis del mismo no interfiere con el comando en sí o que la codificación del contenido sea la incorrecta, etc.
Tomando eso en cuenta suena razonable por qué no existe un argumento para ello ¿no te parece?
Bajar o no a disco es irrelevante si eso soluciona la cuestión, no entiendo porque perder el tiempo con un detalle de implementación.
Aunque llevando las cosas al extremo podrías usar pipes para conectar el comando desde PHP, nunca lo he hecho, pero en teoría suena posible.