Lo que quieres hacer es lo que se denomina "migración de datos", pero para poder darte un consejo tendríamos que conocer la estructura de las bases involucradas, y en especial la estructura de cada tabla que exista en ellas y que se vincule al problema.
De lo que describes no hay nada desde donde empezar. O aportas datos detallados, o buscas en Google el tema.
Migración de datos