Visto lo visto he decidido hacerlo con php. Dejo la función por si a alguien le sirve.
Código PHP:
function rellenarArray($fechaIni, $fechaFin, $datos) {
//print_r($datos);
$datosIni = explode("-", $fechaIni);
$datosFin = explode("-", $fechaFin);
//DATOS INICIO
$anoIni = $datosIni[0];
$mesIni = $datosIni[1];
$mesIni = ltrim($mesIni, "0");
//DATOS FIN
$anoFin = $datosFin[0];
$mesFin = $datosFin[1];
$mesFin = ltrim($mesFin, "0");
//RELLENO MESES
//recorro años
$arrayMeses;
for ($i = $anoIni; $i <= $anoFin; $i++) {
//recorro meses y voy montando un array donde el primer indice es el año y el segundo el mes
if ($anoIni == $anoFin) {
for ($j = $mesIni; $j <= $mesFin; $j++) {
$arrayMeses[$i][$j] = 0;
}
} else if ($i == $anoIni) {
for ($j = $mesIni; $j <= 12; $j++) {
$arrayMeses[$i][$j] = 0;
}
} else if ($i == $anoFin) {
for ($j = 1; $j <= $mesFin; $j++) {
$arrayMeses[$i][$j] = 0;
}
} else {
for ($j = 1; $j <= 12; $j++) {
$arrayMeses[$i][$j] = 0;
}
}
}
if ($datos) {
foreach ($datos as $i => $v) {
$arrayMeses[$v['anio']][ltrim($v['mes'], "0")] = $v['recuento_usuarios'];
}
}
return $arrayMeses;
}