Recuperar valor usando fetch_assoc()

[pateketrueke]

Pues tu código está bien, el tema es que estás guardando un array:

Código PHP:

$_SESSION['userid'] = $user;
 

Porque tu método devuelve un array:

Código PHP:

$user = $stmt->get_result()->fetch_assoc();
$stmt->close();
return $user;
 

Entonces esto está mal:

Código PHP:

$id = $_SESSION['userid'];
echo $id;
 

El error te lo dice bien claro:

PHP Notice: Array to string conversion in "echo $id;"

Porque un array no lo puedes imprimir así.

Necesitas imprimir un valor del array basado en el índice.

O bien, en el momento de guardar el valor en sesión accede al valor que necesites:

Código PHP:

$_SESSION['userid'] = $user['la_columna_del_id_del_usuario_o_lo_que_quieras'];