No puedes hacer consultas de ese tipo debido a que se serializan en la base de datos. Tienes que recuperar el registro y luego hacer búsquedas en el arreglo.
Si necesitas incorporar los elementos del choice en la búsqueda entonces crea una nueva entidad para esos elementos y crea una relación muchos a muchos y en el form utiliza el type entity.
Revisa la documentación:
http://symfony.com/doc/current/refer...es/entity.html