php y mysql varias catergorias para un mismo articulo

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yo solo almacenaria en un campo en formato json las categorias de cada item, de esa manera al recuperar el campo las trabajaria con un foreach o lo que sea que necesites hacer con ellas luego, asi te evitas algunos dolor de cabeza, prieba a ver.

Yo hago eso en un carro de compras para almacenar que categorias de productos estan en promocion en una determinada fecha o rango de fechas y cuando el sistema va a cargar el producto, verifica ese campo y ve si esta en oferta o no y actua en consecuencia. Tambien utilizo el mismo metodo para establecer los permisos que tiene un usuario en el sistema y de esa manera se determina que opciones del menu se muestran y cuales no.