Saludos, investigando aquí en Foros del Web encontré este código lo adapte a lo que necesito funciona a la perfección aquí el código. 
   Código PHP:
    <?php
//Conexion con la base 
    include("config/conectar.php");
      
        $consulta_f = mysql_query("SELECT * FROM facultades ORDER BY cod_dep");
        for ($i=0; $i < $fac = mysql_fetch_array($consulta_f); $i++):
    ?>
        <li><?php $fac['id'] ?><?php echo $fac['cod_dep'].' - '.$fac['dependencia'].'<br/>'; ?>
            <ul>
                <?php
                    $consulta_d = mysql_query("SELECT * FROM depen_facultades WHERE id_facultad = '".$fac['id']."'");
                    for ($j=0; $j < $dep = mysql_fetch_array($consulta_d); $j++):
                ?>
                    <li><?php echo $dep['cod_dep']. ' - '. $dep['dependencia'] ?></li>
                        <?php endfor; ?>
            </ul>
        </li>
        <?php endfor; ?>
             </ul>
        </li>
</ul>   
  Pero el listado es de la siguiente manera
10000 - CONSEJO UNIVERSITARIO
- 10010 - CU/ Consejo
  - 10020 - CU/ Secretaria Ejecutiva
  - 10021 - CU/ Unidad de Administración y Planificación
  - 10030 - CU/Dpto. de Gestión y Producción Documental
  - 10040 - CU/Dpto. de Gestión de Información y Documentación
  - 10270 - CU/ Pensionados y Jubilados
  - 10370 - CU/ Obreros
  
11000 - CONSEJO DE APELACIONES
- 11010 - CONAPEL/ Consejo
  - 11270 - CONAPEL/Pensionados y Jubilados
  - 11370 - CONAPEL/ Obreros
  
Como hacer para que me salga en una tabla de esta manera coloco una imagen ya que no se como colocar en el foro codigo de <tables> para visualizarlas 
Ejemplo: