No veo un error que provoque el comportamiento que mencionas pero si veo un grave error aqui:
Código PHP:
Ver original<title><?php include('seo.php'); echo $titulo;?></title>
<meta name="description" content="<?php include('seo.php'); echo $descripcion;?>">
<meta name=robots content="<?php include('seo.php'); echo $indexar;?>"/>
NO tienes que usar include cada vez que ocupas algo de un archivo, basta conque lo incluyas 1 vez al inicio del documento y podras usarlo en todo el codigo..
Código PHP:
Ver originalinclude("seo.php");
echo funcion ();
echo funcion ()
//y demas
estas tratando de hacer URL amigables? ocupas .htaccess?