Cita: ¿Cuales podrían ser las razones para justificar el uso de librerias cómo ChartJS, y/o HighCharts en comparación con una librería PHP para graficar cómo PHPLot?
Pues básicamente la interacción que ofrece js al usuario con las gráficas.
Pero también el ahorro de recursos de nuestro servidor, ya que siempre va a ser menos costoso generar un conjunto de datos, enviarlos para que el navegador construya la gráfica, que generar el conjunto de datos, procesarlos y generar imagen con la gráfica, para ser enviada.
Seguramente hay más razones, pero esas son para mi las más importantes.