Si no es obligatorio utilizar array_filter y solo quieres saltar el ciclo cuando sea 0, bien puedes hacer un condicional para saltar el 0
Código PHP:
Ver original<?php
$resta = $_POST['resta'];
for ($i=0;$i<count($resta);$i++) {
if ($resta[$i] == 0){
continue;
}
echo "<br>Array Nº" . $i . " : Resta -> " . $resta[$i];
}
?>