Ve como andas con esto:
Código HTML:
Ver original<script type="text/javascript"> var ventana;
function abrir(){
ventana = window.open('ventana.php', "titulo", "width=400, height=400");
}
function cerrar(){
ventana.close(ventana);
}
<input type="button" value="abrir" onclick="abrir();"/> <input type="button" value="cerrar" onclick="cerrar();"/>
Puse variable ventana global por buena práctica