Buenas, en la documentación tienes un ejemplo en php:
Código PHP:
$data_uri = "data:image/png;base64,iVBORw0K...";
$encoded_image = explode(",", $data_uri)[1];
$decoded_image = base64_decode($encoded_image);
file_put_contents("signature.png", $decoded_image);
Solo tendrías que crear un fichero que recibiera ese $data_uri (que se obtiene con el método toDataURL() de signaturePad), y listo