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Iniciado por Alexis88 
Como respuesta al debate generado, si elaboras bien la parte correspondiente al archivo .htaccess, no debería producirse ninguna falla. Una ventaja enorme que ofrece elaborar las URL amigables con la configuración en el .htaccess es que se puede obtener resultados mucho más amigables y orientados al SEO en cuanto a las búsquedas se refiere. No es lo mismo una ruta del tipo
www.ejemplo.com/noticias/index.php?search=liga%20de%20campeones que
www.ejemplo.com/noticias/liga-de-campeones. Eso no lo vas a lograr ni realizando la mejor organización de carpetas que puedas idear.
Claro que se puede lograr con carpetas, éstas permiten tambien "liga-de-campeones", incluso se puede hacer mucho mejor así: dominio.com/ligas/campeones, y asi, dentro de ligas se puede albergar todo tipo de ligas.
Yo no invertiria nada de tiempo en agregar esas urls al htacces precisamente por eso,pq se invierte tiempo y lineas de codigo que uno se puede ahorra con una buena estructura de carpetas, aunque lo mejor para un proyecto así es usar los frameworks.
Di la idea de las carpetas pq muchas de las personas que postean aquí, programan sinhacer uso del MVC y mezclan todos los lenguajes de programacion en el mismo archivo con lo cual la estructura de carpetas es la solucion mas a su nivel pues el htacces se les queda muy avanzado al nivel de programacion que utilizan. En el momento que comienzen a usar el protocolo MVC se les hará mas sencilla la programacion.