Estoy de acuerdo que si no se usa framework ni modelo MVC no vale la pena complicarse con htaccess, es más fácil utilizar una estructura de carpetas.
Solo comentar que si usas una estructura de carpetas y quieres la url
http://viewertravel.com.pe/amazonas/
en vez de
http://viewertravel.com.pe/amazonas/...=Amazonas®=
Vas a tener que pasar los parámetros 'codep', 'depmom' y 'reg' desde javascript mediante una petición "POST" en vez de la petición "GET" que estás utilizando ahora.
Saludos.