Buenas,
Est la ultima version de notepad++?
Para reconocer el codigo HTML utilizas algun plugin ?
Si las respuestas son SI y NO, te recomiendo que le reportes en el foro de la comunidad (
https://notepad-plus-plus.org/community/) o bien crees un issue en su repositorio GitHub (
https://github.com/notepad-plus-plus/notepad-plus-plus).
Si es algun plugin que utilizas, intenta contactar con el autor de dicho plugin.
Un saludo