Solo debes colocar las dos asignaciones del inicio (
arr = [] y
arr2 = []) dentro de la función que se ejecuta cuando se produce el clic. Preferentemente antes del
foreach.
RECOMENDACIÓN: En el futuro, evita mezclar código de diferentes lenguajes de esa manera. Trata de tenerlos por separado; el código PHP en un archivo de extensión ".php" y el código JavaScript en un archivo de extensión ".js". Así obtendrás mayor legibilidad y el código será más fácil de entender y mantener.