solo usa el input en formato array
Código HTML:
Ver original<input class="form-control" type="file" id="archivo" name="archivo" />
cambialo por
Código HTML:
Ver original<input class="form-control" type="file" id="archivo" name="archivo[]" />
con eso podras enviar cuantos archivos quieras por via POST, en el lado de php solo cambia un poco la estructura puedes revisar ,hay multitud de ejemplos en la web