Insert de miles de registros muy lento

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Código PHP:

<?php
$values=array();
$contador=0;
While ($row = OCI_Fetch_Array($rstOpenConvenio)) {
 
    //$resultado = mysqli_query($qMysql, $conn);
    //mysqli_query($conn,"INSERT INTO mesanterior (ss) VALUES ('".$row[0]."')");
    $values[]= "('".$row[0]."','".$row[1]."','".$row[2]."','".$row[3]."','".$row[4]."','".$row[5]."','".$row[6]."','".$row[7]."','".$row[8]."','".$row[9]."','".$row[10]."','".$row[11]."','".$row[12]."','".$row[13]."','".$row[14]."','".$row[15]."','".$row[16]."')";
    if(count($values)>99){// es mayor a 99 hacemos el insert
        $qMysql = "INSERT INTO mesanterior (periodicidad,SS,cargdoso,cargunid,cargconc,concdesc,cargvalor,cargsign,sesuserv,sesususc,sesucate,sesusuca,pefacicl,locadesc,tipodir,copagina,observacion) VALUES ";
        $qMysql .= implode(",\n",$values);
        echo $sql;
        $resultado=mysqli_query($conn,$sql);
        echo count($values)." es multipo de 100 ";
        echo "<br><br>";
        //vaciamos la variable $values
        $values=array();
    }
}
// en caso de que siga existiendo los datos, pero estos no llegaron al limite, realizamos nuevamente la insercion
if(count($values)>0){
$qMysql = "INSERT INTO mesanterior (periodicidad,SS,cargdoso,cargunid,cargconc,concdesc,cargvalor,cargsign,sesuserv,sesususc,sesucate,sesusuca,pefacicl,locadesc,tipodir,copagina,observacion) VALUES ";
        $qMysql .= implode(",\n",$values);
        echo $sql;
        $resultado=mysqli_query($conn,$sql);
 
        echo count($values)." es multipo de 100 ";
        echo "<br><br>";
 
}