Bueno .. "desde PHP"?
Con tu Base de datos interactuas en lenguaje SQL .. en este caso el própio de Mysql (q es "cási" standar ANSI nosecuantos .. pero no completamente).
Desde PHP .. lanzas esas consultas o "peticiones" SQL con la función:
mysql_query() ..
y lo que haga o deje de hacer .. o puedas obtener depende de la sentencia SQL que uses ... Por ende, priméro debes conocer el SQL (sintax) de lo que pretendes hacer para usarlo con tu función mysql_query() y todo lo que ello implica: conectar a tu BD, seleccionar la BD a trabajar .. gestión de errores .. etc .. etc ..
Te recomiendo que leas el manual de Mysql:
www.mysql.com
Busca por "CREATE TABLE" ... y su sintax de uso.
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Otra opción que tienes .. si es sólo para crear tus BD .. tus tablas .. definición de campos .. etc. Puedes usar un administrador de Mysql .. GUI le llaman también (Graphical User Interface) .. Tienes muchos y variados.
El más común es phpMyadmin (
www.phpmyadmin.net) que .. justamente está escrito en PHP y .. lo puedes usar en tus servidores (si es que no lo tienes instalado ya en caso de que uses un servicio de hosting ..)
También tienes en Windows y linux (y multiplataforma en Java también ..) .. En windows tienes el Mysql Front End, SQL Yog, Mysql Studio, Mysql Manager .. y un buen motón más (incluso la própia Mysql.com tiene el suyo ...). Usa google y busca por "mysql+gui" .. veras que salen muchos.
Un saludo,