Cierto, dale la oportunidad de vivir un rato.
Lo mas sencillo es que lo hagas desde los discos de instalacion de linux (no dices que distribucion es SuSe, RedHat, Mandrake o como 150 posibles)
En los discos de instalacion lo mas probable es que tengas un proceso de particionamiento grafico, desde ahi las eliminas y guardas los cambios. Asi podras disponer del disco totalmente, si alguna vez lo has hecho con fdisk de windows, no tendras problemas.