Quizas no me haya explicado bien!!  

 Pero gracias por la respuesta. 
El hecho es que tengo que 'deshacer' el fichero y meter los datos 
particulares que hay en el en la base de datos. 
A ver  

  ej: 
El fichero contiene: 
una estructura que contiene datos, fecha, etc.. pero en binario. 
Yo tengo que sacar estos datos y meter por ejemplo: 
los datos con una fecha determinada en una tabla para poder despues trabajar con esos datos. 
me entendeis?? es como por asi decirlo, una traduccion del fichero binario a los datos que introducire en ASCII en MySQL. 
A ver si ahora si. Venga nos vemos